บางองค์กรยังคงใช้ Windows 2000 หรือแม้แต่ Windows 98 ในการใช้งาน ซึ่งปัจจุบัน Filezilla ไม่ได้ซัพพอร์ต Windows 95, 98, ME, NT4 และ 2000 แล้ว จะต้องติดตั้งบน Windows XP หรือสูงกว่าเท่านั้น
บางองค์กรยังคงใช้ Windows 2000 หรือแม้แต่ Windows 98 ในการใช้งาน ซึ่งปัจจุบัน Filezilla ไม่ได้ซัพพอร์ต Windows 95, 98, ME, NT4 และ 2000 แล้ว จะต้องติดตั้งบน Windows XP หรือสูงกว่าเท่านั้น